То есть компания, например, арендующая несколько помещений по разным адресам, фактически создаёт обособленные подразделения, и поэтому перейти на автоУСН не сможет. 

Отметим, что запрет касается только организаций. Предприниматель с несколькими торговыми точками не создаёт обособленных подразделений по ст. 11 Налогового кодекса РФ, поэтому наличие, например, нескольких магазинов не мешает применять автоУСН.

Таким образом, если организация открыла филиал или обособленное подразделение, нарушив одно из условий применения спецрежима, право на автоУСН теряется с начала календарного месяца, в котором допущено нарушение. В этом случае налогоплательщику нужно:

• подать уведомление об утрате права – в электронной форме через личный кабинет налогоплательщика или через уполномоченный банк (не позднее 15-го числа месяца, следующего за месяцем нарушения);

• выбрать новый налоговый режим – вместе с уведомлением об утрате можно направить уведомление о переходе на УСН или ЕСХН (если поставить соответствующую отметку, переход на выбранный спецрежим произойдёт автоматически с даты утраты права на автоУСН).

Уведомление о переходе на УСН или ЕСХН можно направить вместе с уведомлением об утрате или в течение 30 дней со дня получения уведомления из налогового органа. Если этого не сделать, налогоплательщик будет считаться автоматически перешедшим на общий режим налогообложения с даты утраты права на автоУСН.

Актуальная и подробная информация о специальном налоговом режиме доступна на промостранице «АУСН» официального сайта ФНС России www.nalog.gov.ru.