С 1980 года  он посвятил себя медицине: спасал жизни и здоровье северян, работая хирургом в Киземе и в Котласе, а затем и главврачом Котласской городской больницы. Для многих коллег он был учителем и примером отношения к людям и к своему делу. На протяжении 18 лет он возглавлял департамент здравоохранения Архангельской области, а затем представлял интересы северян в четырёх созывах областного Собрания депутатов, курируя здравоохранение и социальную политику на посту председателя профильного комитета.

При его активном участии многое сделано для совершенствования оказания медицинской помощи жителям Архангельской области, модернизации и оснащения медучреждений, подготовки кадров. Был принят комплексный закон о социальной поддержке семей, воспитывающих детей, в Архангельской области, который ежегодно дополняется новыми нормами.

Сергей Эммануилов удостоен почётного звания «Заслуженный врач Российской Федерации», награжден медалью ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени. В памяти коллег Сергей Дмитриевич останется настоящим профессионалом, человеком большой души, искренне переживавшим за дело и результат.

Соболезнования родным и близким Сергея Дмитриевича выразили депутаты Архангельского областного Собрания, а также глава региона Александр ЦЫБУЛЬСКИЙ.

«Заслуженный врач Российской Федерации, председатель комитета Архангельского областного Собрания депутатов по социальной политике и здравоохранению, он глубоко разбирался в вопросах социальной сферы, вникал в проблемы людей и всегда подходил к их решению не только с профессиональной, но и с простой, человеческой точки зрения. Искренне соболезную семье Сергея Дмитриевича, его родным, близким, коллегам и друзьям. Светлая память», - отметил Александр Витальевич.